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Forum TERATEC 2017
Atelier 2 - Mercredi 28 juin de 9h00 à 12h30
Santé - Perspectives pour une médecine personnalisée en 2025

Simuler des polymères bio actif
Dr. Michel MASELLA, CEA – Centre de Saclay, Direction de la Recherche Fondamentale, Laboratoire de Biologie Structurale et de Radiobiologie

Résumé : Les approches de modélisation moléculaire basées sur des potentiels d’interaction atomique empiriques sont les seules vraiment efficaces pour simuler des systèmes moléculaires sur des échelles de temps pertinentes (nano seconde et au-delà). Toutefois, ces approches sont calibrées sur la base de résultats expérimentaux qui doivent être suffisamment nombreux pour en garantir la qualité. C’est le cas pour des systèmes moléculaires de type peptides/protéines.

Dans le cas de nouveaux systèmes macro moléculaires développés pour mimer les fonctions biologiques de protéines, le peu de données expérimentales disponibles ne permet pas d’employer les approches classiques de modélisation moléculaire en soutien des développements expérimentaux. Notre groupe travaille sur de nouvelles approches de modélisation non plus calibrées sur des données expérimentales mais théoriques. Ces approches sont également bien adaptées aux nouvelles architectures de calcul intensif. Elles permettent donc d’aborder "efficacement" n’importe quel type de système moléculaire, qu’il soit déjà synthétisé ou non.

Cette nouvelle approche de modélisation, dite « ab initio », sera présentée en considérant comme exemple d’application une famille de polymères d’urée développée par l’équipe de Gilles Guichard (Université de Bordeaux-Pessac) et dont notre laboratoire évalue le potentiel en tant que nouvelle classe d’anticancéreux.

Biographie :
  • Ancien élève de l’Ecole Normale Supérieure de Lyon
  • Docteur es Sciences de l ‘Ecole Polytechnique
  • Ingénieur-Chercheur CEA
  • En charge du développement du code de dynamique moléculaire POLARIS(MD)
  • Membre du comité de pilotage du Centre de Calcul et de Recherche Technologique (CCRT)
  • Ancien membre du comité de sélection ANR COSINUS et Modèle Numérique.

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Retrouver les ateliers techniques du Forum TERATEC traitant du HPC dans la santé et télécharger les présentations

Forum Teratec 2016 : Technologies et usages du HPC dans le secteur de la Santé

Forum Teratec 2014 : HPC et Santé : De la recherche thérapeutique à la médecine personnalisée

Forum Teratec 2013 : Le HPC dans la santé

 

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