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Forum TERATEC 2017
Atelier 2 - Mercredi 28 juin de 9h00 à 12h30
Santé - Perspectives pour une médecine personnalisée en 2025

Simuler des polymères bio actif
Dr. Michel MASELLA, CEA – Centre de Saclay, Direction de la Recherche Fondamentale, Laboratoire de Biologie Structurale et de Radiobiologie

Résumé : Les approches de modélisation moléculaire basées sur des potentiels d’interaction atomique empiriques sont les seules vraiment efficaces pour simuler des systèmes moléculaires sur des échelles de temps pertinentes (nano seconde et au-delà). Toutefois, ces approches sont calibrées sur la base de résultats expérimentaux qui doivent être suffisamment nombreux pour en garantir la qualité. C’est le cas pour des systèmes moléculaires de type peptides/protéines.

Dans le cas de nouveaux systèmes macro moléculaires développés pour mimer les fonctions biologiques de protéines, le peu de données expérimentales disponibles ne permet pas d’employer les approches classiques de modélisation moléculaire en soutien des développements expérimentaux. Notre groupe travaille sur de nouvelles approches de modélisation non plus calibrées sur des données expérimentales mais théoriques. Ces approches sont également bien adaptées aux nouvelles architectures de calcul intensif. Elles permettent donc d’aborder "efficacement" n’importe quel type de système moléculaire, qu’il soit déjà synthétisé ou non.

Cette nouvelle approche de modélisation, dite « ab initio », sera présentée en considérant comme exemple d’application une famille de polymères d’urée développée par l’équipe de Gilles Guichard (Université de Bordeaux-Pessac) et dont notre laboratoire évalue le potentiel en tant que nouvelle classe d’anticancéreux.

Biographie : Ancien élève de l’Ecole Normale Supérieure de Lyon Docteur es Sciences de l ‘Ecole Polytechnique Ingénieur-Chercheur CEA En charge du développement du code de dynamique moléculaire POLARIS(MD) Membre du comité de pilotage du Centre de Calcul et de Recherche Technologique (CCRT) Ancien membre du comité de sélection ANR COSINUS et Modèle Numérique.

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Retrouver les ateliers techniques du Forum TERATEC traitant du HPC dans la santé et télécharger les présentations

Forum Teratec 2016 : Technologies et usages du HPC dans le secteur de la Santé

• Vers une médecine numérique en France par Francois SIGAUX, Directeur Scientifique Executif, CEA
• Precision Medicine, Big Data and Smart Cities par Suzanne HOLT BALLARD, Professor, OHIO UNIVERSITY
• Big Data au service de la santé publique par Emmanuel BACRY, Directeur de recherche au CNRS, Responsable de l’Initiative « Data Science » - Centre de Mathématiques Appliquées, Ecole Polytchnique
• Big Data for moderne life sciences : challenges and solutions for Data Access (performances, flexibilty, security and privacy) par James COOMER, Technical Director, DDN - Peter CLAPHAM, SANGER
• Where are the bottlenecks of genome analysis today? par Ivo Glynne GUT, Centro Nacional de Analisis Genomico, CRG, Barcelona

Forum Teratec 2014 : HPC et Santé : De la recherche thérapeutique à la médecine personnalisée

• Les simulations HPC pour le décryptage des interactions moléculaires et l’obtention de nouvelles cibles thérapeutiques par Manuel DAUCHEZ, Professeur de Biophysique et Biochimie Computationnelle, UNIVERSITE DE REIMS CHAMPAGNE-ARDENNE
• Simulations numériques prédictives et personnalisées des interventions endovasculaires pour les anévrismes aortiques abdominaux par Michel ROCHETTE, Director of Research, ANSYS
• Application of Optimization & CFD in Surgical Planning for Percutaneous Coronary Intervention par Silvia POLES, Senior Application Engineer, NOESIS Solutions
  
• Simulations for Abdominal Wall Reconstruction par Frédéric TURQUIER, PhD, Director Research & Development, COVIDIEN Surgical Solutions
• Interpretation of Clinical Exome : Le Big Data comme brique d’assistance aux choix thérapeutiques en oncologie par Philippe RAVIX Directeur Innovation SOGETI HIGH TECH
• Le calcul haute performance pour l'analyse de données de neuroimagerie-génétique en grandes dimensions par Benoit DA MOTA, Expert hpc&bioinformatics, ALLIANCE SERVICES PLUS - Edouard DUCHESNAY, research Engineer, NEUROSPIN

Forum Teratec 2013 : Le HPC dans la santé

• High performance computing and simulation in medicine: scope and challenges par François BALLET, MEDICEN
• La découverte d’approches thérapeutiques innovantes: sous le lampadaire n’est pas forcément le meilleur endroit où chercher par Dr. François IRIS, Chairman & CSO, BIO-MODELING SYSTEMS
• Can HPC help cure Pharma R&D? par Philippe GUILLET, Chief Geriatrician, SANOFI
• Le cerveau de cristal - Ce que nous révèle la neuroimagerie par Denis LE BIHAN, CEA
• Simulation & calcul haute performance : le défi de la chirurgie assistée par ordinateur par Luc SOLER, R&D Director of IRCAD, R&D Director of IHU Strasbourg

Pour toute autre information concernant les ateliers techniques, prière de contacter :

Jean-Pascal JEGU
Tél : +33 (0)9 70 65 02 10 - Mob.: +33 (0)6 11 44 49 59
jean-pascal.jegu@teratec.fr
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2, rue de la Piquetterie
91680 BRUYERES-LE-CHATEL
France