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Atelier 02 - de 9h00 à 12h30
Technologies HPC et santé
Présidé par Daniel Verwaerde, co-fondateur et président, Teratec
Simulation de la propagation de l’épidémie de COVID-19 au sein d’une géographie urbaine réaliste
Par Nicolas Gilet, ingénieur de recherche, Inria
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Le projet ICI (INRIA - Collaboration - IGN) est un simulateur de propagation d’épidémies, particulièrement adapté au COVID-19, reposant sur une modélisation très détaillée d’un espace urbain et de sa population correspondante à l'échelle individuelle. Ce simulateur a pour but d'aider les autorités sanitaires à prendre les meilleures décisions, à l'échelle d'une ville moyenne, pour contrôler au mieux la propagation de l'épidémie.
Plus précisément, le modèle repose sur le couplage de deux modélisations distinctes : d'une part, la modélisation de l'espace géographique urbain où vivent et se déplacent les individus ; d'autre part, la modélisation des choix aléatoires des déplacements et des contaminations éventuelles lors des interactions entre individus.
La représentation géographique est construite grâce à des traitements prenant en compte de nombreuses sources de données (IGN, INSEE, OpenStreetMap, Agence Parisienne d'URbanisme (APUR)).
En raison de la très forte dépendance de l’évolution de l’épidémie à des caractéristiques épidémiologiques et à divers paramètres hétérogènes au sein de la population (temps d’incubation, probabilité de transmission, etc. ), l’ensemble de ces paramètres sont modélisés de manière probabiliste nécessitant des calculs haute-performances sur les grandes structures de calculs (CEA, Grid’5000, calculateurs locaux).
Le simulateur pourra, à terme, être utilisé pour prévenir, prévoir, gérer des propagations d’épidémies autres que la COVID-19. Enfin, il pourrait servir dans des contextes très différents, par exemple dans le processus de conception de moyens de transport adaptés aux modes de vie des habitants, grâce aux modélisations avancées des multiples phénomènes régissant les déplacements.
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Biographie : Docteur en Calcul Scientifique après une thèse effectuée entre 2017 et 2019 dans un laboratoire spatial (CNRS/LPC2E), j’ai rejoint le centre Inria Saclay – Ile de France en janvier 2021 en tant qu’ingénieur de recherche. Je suis actuellement en charge du développement du simulateur ICI, écrit en Julia, et de son portage sur les grands centres de calculs à l’aide d’outils de parallélisation comme MPI. |
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