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Forum TERATEC 2018
Atelier 2 - Mercredi 20 juin de 09h00 à 12h30

HPC, SANTE ET MEDECINE PERSONNALISEE

Les approches omiques appliquées à l’environnement
Eric PELLETIER, Chercheur en génomique environnementale, CEA/Genoscope

Face à la difficulté d’appliquer les approches classiques de la microbiologie à l’étude des organismes dans leurs environnements (nous ne sommes capables de cultiver que quelques pourcents des organismes présents), les outils de la biologie moléculaire s’affranchissant de ce prérequis ont permis d’approfondir nos connaissances dans ces organismes : qui sont-ils, comment vivent-ils et comment interagissent-ils. Ce sont surtout les progrès dans les techniques de séquençage d’ADN et d’ARN, qui ont connu un formidable gain d’efficacité ces 15 dernières années, qui ont marqué ces changements.

Dans cet exposé, le développement de ces méthodes sera abordé, avec des exemples couvrant différents environnements (stations d’épuration, sol, flore intestinale, océans), et une vision prospective sera abordée, notamment avec l’utilisation des dernières méthodes de séquençage molécule unique.

Biographie :Biologiste de formation universitaire (doctorat en immunologie à l’université Pierre et Marie Curie et à l’Institut Pasteur), Eric Pelletier est chercheur au Genoscope puis au CEA. Il est spécialisé dans l’analyse des données génomiques à grande échelle grâce à l’utilisation des outils informatiques. Après sa participation au projet Génome Humain, il s’est intéressé dès 2001 aux approches de génomique environnementale procaryotes (stations d’épuration, sols contaminés, flore intestinale). Il a ainsi participé au projet MetaHit, qui a notamment permis l’établissement du premier catalogue de gènes bactériens de la flore intestinale. Actuellement il travaille sur les aspects de diversité des organismes planctoniques marins eucaryotes dans le cadre du projet Tara Océans, et vient de publier le premier catalogue de gènes de ces organismes.

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