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Atelier 2

Mercredi  1er juillet de 9h00 à 12h30
Calcul haute performance et les sciences du vivant

Président de session : Dr. Marie-Christine SAWLEY, CMS Institute for Particle Physics - ETH Zurich

Les sciences du vivant quantitatives visent à étudier systématiquement les relations entre les molécules, les cellules et les organismes et permet d’ouvrir ainsi de nouveaux horizons à la découverte scientifique. Fondamentalement interdisciplinaires, elles font largement usage des mathématiques, de la chimie physique, du  traitement d'images et du calcul haute performance.  Ce workshop sera l'occasion de mesurer les avancées importantes en pharmacologie, traitement d'images médicales, bioinformatique, modélisation des systèmes biologiques et médecine clinique  grâce au calcul intensif, avec une connotation particulière vers les problématiques industrielles ou de société."

09h00-09h30  

Drug induced effects on the heart: Insights from High Performance Computing simulations
By Dr. Blanca  RODRIGUEZ, Oxford University Computing   Laboratory (UK)

09h30-10h00

Applications and perspectives of HPC  in Pharma: the example of  Merck Serono
By Dr. Friedrich RIPPMANN, Director bio and  Chemoinformatics DA, Merck Serono (Germany)

10h00-10h30

From Diffusion MR Image Analysis to Whole Brain Connectivity Simulation
By Prof. Jean-Philippe THIRAN, Centre d'imagerie   biomédicale EPFL (Switzerland)

10h30-11h00

Pause

11h00-11h30

Biomolecular Science and Data Intensive Informatics
By Dr.  Graham CAMERON, Associate Director European Bioinformatics Institute (Cambridge, UK)

11h30-12h00

From avalanche of biological data to system modeling
By Dr. Ioannis XENARIOS, Director Vital IT (Lausanne, Switzerland)

12h00-12h30

Role of HPC in medecine
By  Dr Arthur THOMAS, CEO Proteus Associates (UK)


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